[ウェブリリース]佐渡島が新潟の降雪量を減らす「佐渡ブロック」のメカニズムを解明

2023年7月27日
筑波大学 計算科学研究センター

概要

日本海に近い北陸地方は、一般的に豪雪地帯であるが、日本海側最大の都市である新潟市は、近隣の都市に比べて降雪量が少ない。その理由として、新潟市の風上に位置する佐渡島が降雪量を減らすという雪陰(注1 効果がある。これは、気象予報士や住民の間で「佐渡ブロック」(注2 と呼ばれ広く信じられているが、その真偽やメカニズムは十分に調査されてこなかった。
本研究では、長期間のレーダーデータの統計解析と典型12事例を対象とした数値実験により、新潟市の降雪に対する佐渡島の雪陰効果の存在とそのメカニズムを明らかにした。その結果、佐渡ブロックは確かに存在し、そのメカニズムは、(1)佐渡島が降雪をもたらすことで、その風下海上の水蒸気・雲水などを減少させる、(2)佐渡島が風下の風速を弱めることで、風下海上から大気への熱と水蒸気の輸送量を減少させる、ことが分かった。

研究内容と成果

はじめに、2005–2014年の冬(12月~2月)のレーダーデータを統計解析した。その結果、強い接近風が佐渡島に到達した188例中151例(80%)で、新潟平野における雪陰効果が発生していたことが分かった。この雪陰の発生位置は常に佐渡島の風下で、風向きに依存していた。すなわち、北西風の時は新潟平野の中でも佐渡の南東に位置する地域で、西風の時は佐渡の東に位置する地域で特に降雪量が少ない傾向が認められた。
次に、典型的な12事例を対象に、気象モデルを用いた数値実験を行った。その結果、気象モデル内で佐渡島がある時の実験の場合、モデル内に佐渡島がない時の実験よりも、新潟平野で降雪量が少ないことが確認された(図1)。
さらに、佐渡島を風上方向(北西方向)に200km移動させた実験を行った結果、佐渡島の雪陰効果は、佐渡島の風下150kmまで現れることが分かった。最後に、佐渡島を北東方向に150km(庄内平野沖に)移動させた実験を行った。その結果、新潟平野の降雪量は、他の平野の降雪量と同程度になった。
数値実験の結果をさらに解析した結果、佐渡島は風下の風を弱めることで風下海面から大気への熱と水蒸気の輸送量を減少させることがわかった。同時に、風下の水平風の収束も弱めることも分かった。また、佐渡島で雪が多く降ることで、風下海上の水蒸気、雲水、雲氷の量を減少させることも明らかとなった。これらの結果、佐渡島は風下海上の雲列の再発達を弱め、新潟市を含む風下平野の降雪を減少させることができると結論づけられた。

今後の展開

今回は季節風が佐渡島に吹き付ける事例を対象に調査した。季節風が弱い場合の佐渡島の雪陰効果や、将来の新潟平野の降雪量に対する佐渡島の雪陰効果などが今後の課題としてあげられる。

参考図

図1: (a) 観測された降水量、(b)佐渡島がある場合の計算結果、(c)佐渡島がない場合の計算結果、(d)佐渡島の雪陰効果(佐渡ブロックの効果 図c-d)。いずれも典型12事例の平均値。

 

用語解説

  • 雪陰:山岳が存在することでその風下側の降雪量が周囲に比べて少なくなる現象、あるいはそのような降雪分布の特徴
  • 佐渡ブロック:佐渡島の存在が季節風によって運ばれてくる雪雲をブロックして、新潟平野の降雪を少なくする効果。気象の専門用語ではなく、気象予報士や住民などによる呼び名。

 

研究資金

環境省・(独)環境再生保全機構「環境研究総合推進費」 JPMEERF20232003

 

掲載論文

題名:The snow-shadow effect of Sado Island on Niigata City and the coastal plain
著者名:Hiroyuki Kusaka, Nobuyasu Suzuki, Masato Yabe, Hiroki Kobayashi
掲載誌:Atmospheric Science Letters
掲載日:2023年7月20日(ウェブ版)
DOI: https://rmets.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/asl.1182

 

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原田准教授らの論文が日本化学会・欧文誌の優秀論文に選出

生命科学研究部門・生命機能情報グループの原田准教授、Hengphasatporn助教、重田教授等の論文が、日本化学会・欧文誌 Bulletin of the Chemical Society of Japan の優秀論文に選出されました。

選出論文はこちら
A Structural Refinement Technique for Protein-RNA Complexes Based on a Combination of AI-based Modeling and Flexible Docking: A Study of Musashi-1 Protein

【CCSで学ぶ】セレスタ プラギャンさん

セレスタ プラギャン(Pragyan SHERESTHA)さん

 

筑波大学 システム情報工学研究群 エンパワーメント情報学プログラム
画像情報研究室 博士前期課程2年

 

(内容は、2022年7月取材当時のものです。)


セレスタさんは、筑波大学 工学システム学類在籍時に画像情報研究室に入り、北原格 教授の指導のもとで研究を続けています。

どんな研究をしているの?

エックス線レントゲン画像から骨の3次元モデルを復元する研究を行っています。普通のカメラで撮影した画像からの3次元復元の技術は、最近では身近になってきています。ところが、その技術がエックス線画像には通用しません。エックス線画像からの3次元復元ができない理由としては、別々の画像上で同じ場所の対応をつけるのが難しいという問題があります。そこの部分にチャレンジしようと思って、この研究を始めました。

 

今の研究室に進んだ理由

画像情報研究室はコンピュータービジョンと画像処理技術を使った応用的な研究を行なっているところで、自分もそういった技術の応用の部分を研究したいと思っていて、研究テーマが一致したので選びました。

研究をすること、ここが魅力!

深層学習を用いて研究をしているので、さまざまな深層学習のモデルや学習アルゴリズムを組んだりするんですけれども、それがうまくいった時には凄い喜びがあります。
また、他の人がどのような研究をしているのか、関連研究や先行研究の調査を行なっている時に、色々なアプローチが見られて感動したり、新しい発見があったりすると楽しいです。

 

メッセージ

大学は色々な人がいて、色々な授業があって、色々な団体がいて、そして色々な先生がいらっしゃるので、すごく選択肢が豊富なところです。自分の身を置く環境が変わると、自分の考え方とか興味も変わってくると思うので、何かを選ぶ時には慎重になって選んだ方がいいのかなと思います。

 

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↓ インタビュー動画もあります。

 

典型元素を利用した高活性アルカリ水電解触媒を開発

2023年7月11日

国立大学法人筑波大学
高知県公立大学法人高知工科大学
国立大学法人東京農工大学

カーボンニュートラル社会の実現と持続には、水素関連技術の開発が欠かせません。水素は水の電気分解で得られますが、現在用いられている触媒には希少で高価な貴金属が使われています。我々は、埋蔵資源量が豊富で安価なホウ素と硫黄を使った新しい高活性水電解触媒を開発しました。

温室効果ガスの排出量と吸収量が均衡したカーボンニュートラル社会の実現のためには、化石燃料の利用率の低減だけでなく、太陽光発電や風力発電などで生成した再生可能エネルギーを効率よく利用しなければなりません。また、再生可能エネルギーを利用して水を電気分解(水電解)して得られる水素(グリーン水素)の活用も、環境負荷を低減する上で重要です。水電解を効率よく行うために、酸素発生反応を促進する電極触媒が用いられます。現在は、ルテニウムやイリジウムのような希少で高価な貴金属が電極触媒に使用されていますが、我々の社会を持続的に発展させていくためには、より埋蔵資源量が豊富で安価な元素を利用した、新しい電極触媒材料の開発が不可欠です。

これまでに本研究グループは、このような新しい電極触媒材料となる可能性のある物質として、埋蔵資源量が豊富なホウ素と硫黄が1:1の組成比で構成される菱面体硫化ホウ素(r-BS)の合成を報告してきました。本研究では、r-BSをシート状の炭素であるグラフェンナノプレート(GNP)と複合化した、r-BS+Gの合成に成功しました。このr-BS+Gをアルカリ水溶液中での水電解の電極触媒材料として用いたところ、酸素発生反応に対して高い触媒活性が得られました。r-BS+Gの触媒活性をさらに向上させることで、実用的なグリーン水素製造装置への応用が期待されます。

 

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掲載論文

【題名】
Boron monosulfide as an electrocatalyst for the oxygen evolution reaction.
(酸素生成反応の電極触媒としての硫化ホウ素)
【掲載誌】
Chemical Engineering Journal
【DOI】
10.1016/j.cej.2023.144489

 

二酸化炭素の還元触媒について、 構造と電気化学特性の関係をナノスケールで解明~副反応を抑えた二酸化炭素還元のための触媒開発に貢献~

2023年6月9日

国立大学法人東海国立大学機構 名古屋大学大学院工学研究科の河邉 佑典 博士課程後期学生,同大学院工学研究科/国立大学法人金沢大学ナノ生命科学研究所(WPI-NanoLSI)の高橋 康史 教授らの研究グループは,筑波大学の伊藤 良一 准教授,堀 優太 助教との共同研究で,触媒表面で生じる二酸化炭素還元反応を,電気化学的にイメージングする技術を確立し,水素ガスなどの副生成物を抑え,化成品を効率的に生成する電解合成触媒の反応メカニズムの理解に成功しました。

 再生可能エネルギーを活用した電気化学的な二酸化炭素の還元は,二酸化炭素を資源として化成品を電解合成できる有力なカーボンニュートラル技術の一つです。その一方で,化成品を電解合成できる触媒では,水素ガスなどの副生成物が生じてしまうという課題を抱えています。本研究は,効率的な化成品の電解合成に向けて,副生成物を抑えられる電解合成触媒の特徴の理解を目指しました。走査型電気化学セル顕微鏡(SECCM)を用いて触媒の幾何学構造と電気化学データを同時マッピング計測することで,幾何学構造と電気化学データが一対一で対応付けを実現させました。

 さらに,第一原理計算により触媒活性サイトにおける反応メカニズムをシミュレーションすることで,二酸化炭素の還元に必要な特徴を明らかにしました。

 本研究成果は,2023 年 6 月 5 日付アメリカ化学雑誌『ACS Nano』に掲載されました。

図:(a) SECCMによる電気化学イメージングの計測原理図,(b)SnS2ナノシートと(c)MoS2ナノシートの還元電流のイメージ,(d)SnS2ナノシートのエッジとテラスでの触媒活性評価

 

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掲載論文

【題名】 
1T/1H-SnS2 Sheets for Electrochemical CO2 Reduction to Formate
【掲載誌】 
ACS Nano
【DOI】
10.1021/acsnano.2c12627

[ウェブリリース]タンパク質の構造変化の違いが除草剤の効き目に関与する可能性を提案

2023年6月5日
筑波大学 計算科学研究センター

概要

雑草防除のために広く利用される除草剤の一つとして、4-ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)阻害型除草剤が知られています。HPPDの阻害剤結合部位は植物間でほとんど差が無いにも関わらず、一部の植物種のHPPDに対してはHPPD阻害型除草剤が結合しにくいことが知られています。このような結合活性の種差を生み出しているメカニズムを理解することは、新しい農薬を設計するうえで重要です。本研究では、分子動力学計算(MD)に基づく独自開発の構造変化抽出法(PaCS-MD法(注1)、OFLOOD法(注2))により、植物HPPDの構造変化(ダイナミクス)を抽出し、HPPD阻害型除草剤であるメソトリオンと植物HPPDの相互作用変化を評価しました。MDの計算結果を解析したところ、HPPDのC末端に存在するαヘリックス構造(α-Helix)の動きは、植物種によって異なることが明らかになり、α-Helixの動きの違いが植物種によるHPPD阻害型除草剤の効果の違いに関与することが示唆されました。

研究内容と成果

HPPD阻害型除草剤は広葉雑草であるシロイヌナズナのHPPDに対して強く結合する一方で、イネ科雑草であるエンバクのHPPDに対してはあまり強く結合しないことが知られています。HPPDの阻害剤結合部位の構造は植物間でほとんど差がなく、このような結合活性の差を生み出している要因は明らかになっていませんでした。本研究では、このような活性差の要因を明らかにするため、MDに基づきシロイヌナズナHPPDとエンバクHPPDの構造変化を調べました。計算結果を解析したところ、メソトリオンが結合していないアポ体では、シロイヌナズナHPPDの阻害剤結合部位は開いた状態にあるのに対し、エンバクHPPDの阻害剤結合部位はC末端に存在するα-Helixにより蓋をされた閉じた状態にあることを確認しました。つまり、メソトリオンはシロイヌナズナHPPDに対しては容易に結合できる一方で、エンバクHPPDには結合しにくいことが示唆されました。また、メソトリオンが結合した複合体では、シロイヌナズナHPPDの阻害剤結合部位はa-Helixにより蓋をされた閉じた状態にあるのに対し、エンバクHPPDの阻害剤結合部位は開いた状態にあることを確認しました。したがって、メソトリオンのシロイヌナズナHPPDからの解離は起こりにくい一方で、エンバクHPPDからの解離は起こりやすいことが示唆されました。以上の解析結果から、植物種によってα-Helixの動きが異なるため、HPPD阻害型除草剤のHPPDへの結合活性の植物種差が生じていると考えられます。

今後の展開

本研究結果から、HPPDのC末端に存在するα-Helixの動きを調節するような薬剤を設計することで、新しいHPPD阻害型除草剤の創出に繋がることが期待されます。また、本研究で実施した計算科学的アプローチは、独自開発の構造変化抽出法(PaCS-MD法、OFLOOD法)であり、従来のMDと比較して低い計算コストで効率的にタンパク質の構造変化を抽出できます。このため、生体機能と密接に関係しているタンパク質の構造変化を抽出し、構造変化と共役する相互作用を定量的に評価できます。今後の展開として、本アプローチを医農薬のさまざまな標的タンパク質に適用していくことで、医農薬設計の効率化に貢献することが期待されます。

参考図

図1:本研究で得られたHPPD阻害型除草剤の植物選択性メカニズム。植物種によってHPPDの構造変化(ダイナミクス)が異なるため、阻害剤のHPPDへの結合のしやすさ(親和性)が変化する。

用語解説

注1)PaCS-MD:短時間MDの実施と構造変化を引き起こす可能性の高い状態の選択とを繰り返すことで、効率よくタンパク質の構造変化を抽出する計算手法

注2)OFLOOD:短時間MDの実施と未知の状態(外れ値)の探索を繰り返すことで、効率的にタンパク質がとりえる構造を探索する計算手法

研究資金

本研究は、生命金属科学(22H04800)、CREST自在配列(JPMJCR20B3)および筑波大学計算科学研究センター学際共同利用プログラムによって実施されました。

掲載論文

【題 名】 Determination of the Association between Mesotrione Sensitivity and Conformational Change of 4-Hydroxyphenylpyruvate Dioxygenase via Free-Energy Analyses
【著者名】 Yohei Munei, Kowit Hengphasatporn, Yuta Hori, Ryuhei Harada, Yasuteru Shigeta
【掲載誌】 Journal of Agricultural and Food Chemistry
【掲載日】 2023年6月5日
【DOI】 DOI: 10.1021/acs.jafc.3c01253
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jafc.3c01253

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筑波大学のPegasus、国内唯一のH100GPU搭載システムとしてTOP500リストに掲載

2023年5月にドイツ・ハンブルクで開催されたISC2023において、スーパーコンピュータTOP500のリストが更新されました。
世界に5台しかないNVIDIA社のH100GPUを搭載したシステムのうちの一つが筑波大学のPegasusで、国内ではH100を搭載した唯一のシステムとしてTOP500リストに掲載されました(世界190位)。
 
国内最高の電力性能を実現したMN-3とほぼ同じ電力性能で、一般ユーザーに公開されている
HPC向けシステムとしては国内最高の電力性(Green500で世界12位)となりました。
 
参考リンク:
 

筑波大学のPegasusがIO500で国内ファイルシステムの最高位に

2023年5月に公開されたIO500リストで、 Pegasus で実行した CHFS が10ノードチャレンジで21位となりました。

https://io500.org/list/isc23/ten

また、全体リストにおいても 28位となり、これまで国内首位であったJCAHPC の Oakforest-PACS の IME の性能を超えて、国内のファイルシステムとしては最高位となりました。

庄司光男助教が量子生命科学会令和5年度学会賞を受賞

計算科学研究センター生命科学研究部門の庄司 光男助教が、量子生命科学会令和5年度学会賞(研究奨励賞)を受賞し、5月19日に授賞式が行われました。
受賞タイトル及び受賞理由は以下の通りです。

受賞タイトル「量子化学計算を活用した複雑酵素反応および生体分子ホモキラリティ機構の解明」
酵素に代表される生体構成分子の電子状態および分子物性における顕著な量子力学的選択性や反応性の理論的解明を目指して、主に量子古典混合計算法などに基づき、光合成光化学系、金属含有タンパク質、ホモキラル・アミノ酸前駆体等の特異な量子物性を明らかにした。

 

関連リンク:量子生命科学会 https://quliss.org/information

 

 

佐藤助教らがHPCIソフトウェア賞開発部門賞の奨励賞を受賞

計算科学研究センターに在籍していた研究者らが中心となって開発したソフトウェア「SALMON(Scalable Ab-initio Light-Matter simulator for Optics and Nanoscience; https://salmon-tddft.jp/)」が、HPCIソフトウェア賞開発部門賞において奨励賞を受賞し、令和5年5月19日(金)に授賞式(オンライン)が行われました。

この賞は、一般社団法人HPCIコンソーシアム(https://www.hpci-office.jp/)が、大規模計算などの計算科学分野の発展に貢献したソフトウェアのうち特に有益と認められたソフトウェアの開発者・団体、あるいは普及に貢献した者・団体を奨励することを目的に設立したものです。 

本賞は開発者の中でも40歳以下の若手が対象となるもので、センターからは佐藤 駿丞助教が受賞しました。

関連リンク:https://hpci-c.jp/news/file/20230428_hpci_award.pdf

計算情報学研究部門(計算メディア分野)助教(テニュアトラック)公募 (締切5月31日)

1.募集人員
助教(テニュアトラック)1名

2.所属組織
筑波大学計算科学研究センター

3.専門分野
医療映像処理、複合現実感・拡張現実および計算メディア技術

4. 職務内容
筑波大学計算科学研究センター*1では、物理学・化学・生物学などの基礎科学、および、計算シミュレーション技術を用いて医学分野と連携し、計算科学による医療技術を開拓する「計算メディカルサイエンス事業」に取り組んでいます。この事業の中のプロジェクトの一つである“3D Surgical Vision”では、3次元映像に基づいた状況認識と拡張現実提示を統合することにより、施術手順や医療技術の直感的な把握を可能とする3次元手術ナビゲーションを実現し、施術レベル・教育効果の向上を目指すと共に、遠隔診断・治療システムの実現を目的とした研究に取り組んでいます。
本公募では、上記計算メディカルサイエンスの研究を行っていただける方を求めます。特に、着任後は意欲的に医学分野と連携して研究活動を推進していただける方を希望します。
また、応募者の適性を判断して、大学院システム情報工学研究群(知能機能システム学位プログラム*2、エンパワーメント情報学プログラム*3)における研究・教育、ならびに、理工学群工学システム学類*4(学部に相当)における教育も担当していただきます。
 *1 計算科学研究センター http://www.ccs.tsukuba.ac.jp
 *2 システム情報工学研究群知能機能システム学位プログラム http://www.imis.tsukuba.ac.jp
 *3 システム情報工学研究群エンパワーメント情報学プログラム http://www.emp.tsukuba.ac.jp
 *4 理工学群工学システム学類 https://www.esys.tsukuba.ac.jp

5. 着任時期
2023年度9月1日以降のできるだけ早い時期。

6. 任期
任期5年間のテニュアトラック(基本年俸表適用職員)着任時から原則5年目に学内規定に基づくテニュア審査が行われ、テニュアが取得できた場合は任期なしとなります。

7. 勤務地住所
〒305-8577 茨城県つくば市天王台1-1-1

8. 応募資格
博士の学位を有し(着任時期までに取得見込みも可)、専門分野において優れた研究業績をお持ちで、上記職務に熱意を持って取り組んでいただける方。

9. 待遇
給与:本学規定による。
勤務時間:専門業務型裁量労働制適用(みなし労働:1日7時間45分、週5日勤務、週38時間45分)
雇用形態:常勤
任期:着任日から最長で5年間(テニュアトラック制)
時間外労働:有り(入試、全学的行事、その他臨時業務)
休日:日曜日,土曜日,祝日,12月29日〜1月3日
各種保険:文科省共済組合、厚生年金、雇用保険、及び労災保険等に加入。
 【参考】
 国立大学法人筑波大学本部等職員就業規則
 https://www.tsukuba.ac.jp/images/pdf/2005hks07.pdf
 国立大学法人筑波大学本部等職員の給与に関する規則
 https://www.tsukuba.ac.jp/images/pdf/2005hks08.pdf

10. 募集締切
2023年05月31日 必着

11. 提出書類:

  1.  応募概要:氏名、生年月日、現在の所属と職、査読付き学術誌掲載論文数、査読付き国際会議論文数、専門分野を表すキーワード5個を、1ページ以内に記載すること。
  2. 履歴書:連絡先、電子メールアドレス、高等学校卒業後の学歴・職歴・研究歴、所属学会等を記載すること。写真を付けること。
  3. これまでの研究の概要:1,500字程度.⑤の主要論文を適宜参照すること。
  4. 研究業績一覧.査読付き学術誌掲載論文、査読付き国際会議論文、著書、査読無論文、解説、特許、受賞、競争的外部資金獲得実績(期間、金額、研究代表者・分担者の区別を明記)、報道、その他などに分類したリスト。共著者名は全員記入すること。⑤に記載した論文に〇印を付けること。
  5. 主要論文リスト 5編:最近5年以内のもの。ただし、1編はそれ以前のものでも可。査読付き学術誌掲載論文について、分かる場合はIF=Impact Factor、SNIP=Source Normalized Impact per Paper、被引用文献数(参照したデータベースも明記)を記載のこと。また、査読付き国際会議論文について、わかる場合は会議の h5-index,CORE rank,採択率,被引用文献数(参照したデータベースも明記)を記載すること。
  6. 5に記載した主要論文のコピー。
  7. 教育業績 :過去の担当科目・TA経験、指導学生の受賞、学生の指導実績など。
  8. 着任後の研究・教育に対する計画・抱負と自己アピール:1,500字程度。
  9. 本人についての意見を求め得る方2名の氏名、所属および連絡先。
  10. 特定類型自己申告書:本学所定の様式を以下サイト*から入手し、必要事項を記入し、署名すること。
  11. GDPR適用国(EU加盟国,アイスランド共和国,リヒテンシュタイン公国,ノルウェー王国,英国)からの応募者は、本学所定のGDPR同意書を以下サイト*から入手し、必要事項を記入し、署名すること。該当しない方は提出不要です。
    ※提出書類の様式および記入例は下記URLからダウンロードできます。
    https://www.ccs.tsukuba.ac.jp/reqdocuments/

12. 問い合わせ先
筑波大学 計算科学研究センター計算情報学研究部門 教授 亀田能成
Tel: 029-853-5256 / E-mail: kameda _AT_ ccs.tsukuba.ac.jp
(_AT_ を @ に置き換えてください。)

13. 応募書類送付先
以上の①から⑪を一つのPDFファイルにまとめ、「JREC-IN Portal Web応募」で提出してください。なお、⑩と⑪は必要事項を記入し、署名した書類をスキャンしたものを提出してください(⑩と⑪は後日原本をお送りいただきます)。

JREC-IN 公募情報掲載ページ:https://jrecin.jst.go.jp/seek/SeekJorDetail?fn=3&id=D123041472&ln_jor=0

14. その他
(1) 応募書類に含まれる個人情報は、本人事選考のみに使用し、他の目的には一切使用しません。選考終了後はすべての個人情報を適切に破棄します。
(2) 計算科学研究センターは、文部科学省共同利用・共同研究拠点に認定されており、計算機共同利用を含む学際計算科学を推進しています。筑波大学では男女雇用機会均等法を遵守した人事選考を行っています。
(3) 本学は、「男女共同参画社会基本法」の精神及び「筑波大学ダイバーシティ基本理念・基本計画」の理念・方針に則った人事選考を行っております。
(4) 本学では、「外国為替及び外国貿易法」に基づき、「国立大学法人筑波大学安全保障輸出管理規則」を定め、外国人、外国の大学・企業・政府機関等出身者又は特定類型該当者の雇用に際し厳格な審査を実施しています。

2023年度 一般公開:スーパーコンピュータ「Cygnus」を見に行こう!

2023年度計算科学研究センター一般公開を、2023年4月22日(土)に開催いたします。

2019年4月に運用を開始したスーパーコンピュータ「Cygnus」 を見学できます。また、スーパーコンピュータを使った宇宙の研究についての講演を行います。

予約等は不要です。直接会場までお越しください。

【講演】「スーパーコンピュータを使った宇宙の研究」

計算科学研究センター ワークショップ室 (14:00-14:30)
話し手:福島肇 先生

【施設見学】

計算科学研究センター 計算機室 (13:00-16:00):

スーパーコンピュータCygnusを間近でご覧いただけます!

計算科学研究センター 1F 展示フロア (13:00-16:00):

歴代のスーパーコンピュータやスーパーコンピュータOakforest-PACSのノードを展示しています。

日 程:2023年4月22日(土)

場 所:筑波大学計算科学研究センター 交通アクセス

参加費:無料。団体見学可(事前にご連絡ください)。

お問合せ:pr [at] ccs.tsukuba.ac.jp (@を[at]と表示しています)

関連リンク:
筑波大学科学技術週間キッズユニバーシティ

4月22日、筑波大学では計算科学研究センター以外でも、特別授業や科学実験をはじめ、さまざまなイベントを開催します。「一日筑波大生」になって、科学の面白さと大学の魅力を体感しよう!

2023年4月
一般公開実施担当者一同

Job opening of Assistant Professor (fixed term) position in CCS, University of Tsukuba

Position Title: Assistant professor (fixed term)

Affiliation: Division of Life Science, Center for Computational Sciences, University of Tsukuba

Field of Expertise: Computational chemistry including materials informatics, quantum chemistry, and molecular simulations.

Research: In our center, we seek a fixed-term assistant professor to develop computational methods using materials informatics (MI), classical molecular dynamics (MD) simulations, quantum chemical (QC) calculations, and/or apply it to actual problems in the field of the grant-in-aid for Transformative Research Areas “Mesohierarchy”. The successful candidate will be a member of the Divisions of Life Science. He/She will collaborate with experimental researchers in the field of Mesohierarchy. Based on the candidates’ expertise, he/she can teach in the faculty of physics, chemistry, or biology.

Starting date: October 1st, 2023 or later, as soon as possible

Period: Until September 30th, 2026 (After evaluation, he/she can extend it until March 31st, 2027)

Requirement: Applicants must have a doctoral degree or equivalent expertise.

Compensation
・Salary
: Annual salary system (The annual salary will be determined based on the regulations of the University, taking into account the career of the employee.)
・Working hours: Discretionary labor system
・Holidays: Saturdays, Sundays, national holidays, New Year’s holidays (Dec.29 Jan. 3), and holidays determined by the University.

Submissions
1) Resume/CV (with photograph)
2) List of research activities including peer-reviewed papers, peer-reviewed proceedings, oral presentations at international conferences, competitive research funds (representative), awards, and so on.
3) Up to five major papers (at least four of which were published within the last five years)
4) Summary of research to date (within 1 sheet of A4 paper)
5) Research and education proposal (within 1 sheet of A4 paper)
6) A list of grants
7) A recommendation letter or the name of one professor, who is a reference for the applicant, with complete contact information
8) A document for Self-declaration on Specific Categories (*)
9) A document for Consent to Processing and Extraterritorial Transfer of Personal Data under GDPR (*) (EU General Data Protection Regulation) (Only the applicants located in the countries where belong to the European Economic Area or in the United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland should submit the consent form).
*All of the standardized forms can be downloaded from the following link: https://www.ccs.tsukuba.ac.jp/reqdocuments/

Submission deadline: Wednesday, May 31th, 2023 (JST).
Please write “Application for Assistant Professor Position in Computational Medical Science (Mesohierarchy)” on the subject and send a zip file with a password for the documents (1-6) in the pdf format via e-mail to apply_2023_L02 [at]ccs.tsukuba.ac.jp ([at] should be replaced by @). The password should be separately sent to shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp ([at] should be replaced by @ as well).

Contact address: Yasuteru Shigeta
(Tel: +81-29-853-6496, Email: shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp)

Miscellaneous: The Center for Computational Sciences has been approved as a Joint Collaborative Research Center by the Ministry of Education, Culture, Sports, Science, and Technology. We promote interdisciplinary computational sciences, including joint use of our supercomputer systems. The University of Tsukuba conducts its personnel selection process in compliance with the Equal Employment Opportunity Act.

生命科学研究部門 助教(任期付)公募(締切5月31日)

公募人員:任期付き助教1名

所属組織:筑波大学計算科学研究センター

専門分野:当センターでは, 学術変革領域研究A「メゾヒエラルキーの物質科学」において, マテリアルズインフォマティクス, 分子シミュレーション, 量子化学計算などを用いたメゾヒエラルキー物質の構造形成・機能発現メカニズムに関する研究を実施する, 任期付き助教を募集します。また,応募者の適性を判断して, 大学院理工情報生命学術院, および理工学群,あるいは, 生命環境学群において,教育・研究指導を担当していただきます。実験研究者との共同研究に意欲的に取り組んで頂ける方を希望します。

着任時期:2023年10月以降できるだけ早い時期

任期:3年 (審査を経て1年6ヶ月延長の可能性があります)

応募資格:博士の学位を有する者, あるいはそれと同等の力量をもつ者

提出書類
1)履歴書(写真貼付)
2)業績リスト(査読論文とその他を区別すること)
3)主要論文別刷5編(うち4編以上は最近5年以内のもの)と要約(それぞれA4用紙1枚分程度)
4)これまでの研究の概要(A4用紙1枚分程度)
5)着任後の研究計画と教育に関する抱負(それぞれ、A4用紙1枚分程度)
6)外部資金の獲得状況
7)照会可能者1名の氏名・連絡先、もしくは推薦書
8)特定類型自己申告書※
9)EU一般データ保護規則(GDPR)に基づく個人データの取扱い及び域外移転に関する同意書※ (欧州経済領域(European Economic Area)の構成国及び英国在住 者のみ提出をお願いします。)

※提出書類の様式および記入例は下記URLからダウンロードできます。
https://www.ccs.tsukuba.ac.jp/reqdocuments/

応募締切:2023年5月31日(水)必着

応募方法:サブジェエクト名を「助教公募(学術変革領域研究A)」として、上記のファイルを圧縮し、暗号化した上で apply_2023_L02[at]ccs.tsukuba.ac.jp までメール送付してください。パスワードは、shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jpにお送りください。([at]→@)

【問合せ先】重田 育照(Tel: 029-853-6496, Email: shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp)

その他:計算科学研究センターは,文部科学省共同利用・共同研究拠点に認定されており,計算機共同利用を含む学際計算科学を推進しています。本学は、「男女共同参画社会基本法」の精神及び「筑波大学ダイバーシティ基本理念・基本計画」の理念・方針に則った人事選考を行っております。また、本学は、「外国為替及び外国貿易法」に基づき、「国立大学法人筑波大学安全保障輸出管理規則」を定め、外国人、外国の大学・企業・政府機関等出身者又は特定類型該当者の雇用に際し厳格な審査を実施しています。

Job opening of Professor/Associate Professor (fixed term) position in CCS, University of Tsukuba

Position Title: Professor or Associate professor (fixed term)

Affiliation: Division of Life Science, Center for Computational Sciences, University of Tsukuba

Field of Expertise: In the Center for Quantum and Information Lifesciences, experimental or theoretical research on the structural dynamics and functional expression mechanisms of proteins and other biomolecules.

Research: In our center, we seek a fixed-term professor/associate professor to develop experimental or computational methods to reveal the structural dynamics and the functional expression mechanisms of proteins. The successful candidate will be a member of the Divisions of Life Science. He/She will collaborate with other members in the center. Based on the candidates’ expertise, he/she can teach in the faculty of physics, chemistry, or biology.

Starting date: August 16th, 2023 or later, as soon as possible

Period: Until March 31st, 2027

Requirement: Applicants must have a doctoral degree or equivalent expertise.

Compensation
・Salary: Annual salary system (The annual salary will be determined based on the regulations of the University, taking into account the career of the employee.)
・Working hours: Discretionary labor system
・Holidays: Saturdays, Sundays, national holidays, New Year’s holidays (Dec.29 Jan. 3), and holidays determined by the University.

Submissions
1) Resume/CV (with photograph)
2) List of research activities including peer-reviewed papers, peer-reviewed proceedings, oral presentations at international conferences, competitive research funds (representative), awards, and so on.
3) Up to five major papers (at least four of which were published within the last five years)
4) Summary of research to date (within 1 sheet of A4 paper)
5) Research and education proposal (within 1 sheet of A4 paper)
6) A list of grants
7) A recommendation letter or a list of names of two professors, who are references for the applicant, with complete contact information
8) A document for Self-declaration on Specific Categories (*)
9) A document for Consent to Processing and Extraterritorial Transfer of Personal Data under GDPR (*) (EU General Data Protection Regulation) (Only the applicants located in the countries where belong to the European Economic Area or in the United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland should submit the consent form).

*All of the standardized forms can be downloaded from the following link: https://www.ccs.tsukuba.ac.jp/reqdocuments/

Submission deadline: Wednesday, May 24th, 2023 (JST).
Please write “Application for Professor/Associate Professor Position in Quantum and Information Lifesciences ” on the subject and send a zip file with a password for the documents (1-6) in the pdf format via e-mail to apply_2023_L01 [at]ccs.tsukuba.ac.jp ([at] should be replaced by @). The password should be separately sent to shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp ([at] should be replaced by @ as well).

Contact address: Yasuteru Shigeta
(Tel: +81-29-853-6496, Email: shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp)

Miscellaneous: The Center for Computational Sciences has been approved as a Joint Collaborative Research Center by the Ministry of Education, Culture, Sports, Science, and Technology. We promote interdisciplinary computational sciences, including joint use of our supercomputer systems. The University of Tsukuba conducts its personnel selection process in compliance with the Equal Employment Opportunity Act.

生命科学研究部門 教授もしくは准教授(任期付)公募(締切5月24日)

公募人員:任期付き教授、もしくは准教授1名

所属組織:筑波大学計算科学研究センター

専門分野:当センターでは, 拠点形成事業「量子生命情報研究センター」において, タンパク質などの生体内分子の構造ダイナミクス・機能発現メカニズムに関わる, 実験もしくは理論研究を実施する, 任期付き教授, もしくは准教授を募集します。また,応募者の適性を判断して, 大学院理工情報生命学術院,および理工学群,あるいは, 生命環境学群において,教育・研究指導を担当していただきます(複数の教育組織の中から選ぶことができます)。量子生命情報科学センターに所属する研究者との学際的共同研究に意欲的に取り組んで頂ける方を希望します。センターに関する情報については, 下記の問い合わせ先に連絡をしてください。

着任時期:2023年8月以降できるだけ早い時期
任期:2027年3月末まで
応募資格:博士の学位を有する者
提出書類
1)履歴書(写真貼付)
2)業績リスト(査読論文とその他を区別すること)
3)主要論文別刷5編(うち4編以上は最近5年以内のもの)とその要約(A4用紙1枚程度)
4)これまでの研究の概要(A4用紙1枚分程度)
5)着任後の研究計画と教育に関する抱負(A4用紙1枚分程度)
6)外部資金の獲得状況
7)照会可能者2名の氏名・連絡先、もしくは推薦書
8)特定類型自己申告書※
9)EU一般データ保護規則(GDPR)に基づく個人データの取扱い及び域外移転に関する同意書※ (欧州経済領域(European Economic Area)の構成国及び英国在住者のみ提出をお願いします。)
※提出書類の様式および記入例は下記URLからダウンロードできます。
https://www.ccs.tsukuba.ac.jp/reqdocuments/

応募締切:2023年5月24日(水)必着
応募方法:サブジェエクト名を「教授、もしくは准教授公募(量子生命情報研究センター)」として、上記のファイルを圧縮し、暗号化した上で apply_2023_L01[at]ccs.tsukuba.ac.jp までメール送付してください。パスワードは、shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp にお送りください。([at]→@)

【問合せ先】重田 育照(Tel: 029-853-6496, Email: shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp [at]→@)

その他:計算科学研究センターは,文部科学省共同利用・共同研究拠点に認定されており,計算機共同利用を含む学際計算科学を推進しています。本学は、「男女共同参画社会基本法」の精神及び「筑波大学ダイバーシティ基本理念・基本計画」の理念・方針に則った人事選考を行っております。また、本学は、「外国為替及び外国貿易法」に基づき、「国立大学法人筑波大学安全保障輸出管理規則」を定め、外国人、外国の大学・企業・政府機関等出身者又は特定類型該当者の雇用に際し厳格な審査を実施しています。

Computational Science Seminar on Next Generation Quantum Chemical Theory

Dr. Samantha Jenkins is invited to present a seminar on the next generation of quantum chemistry theory (NG-QTAIM).

Date: April 26 (wed), 2022 12:00-
Venue: Meeting Room B, Center for Computational Sciences, University of Tsukuba
Language: English

Speaker: Professor Dr. Samantha Jenkins
Presentation title: Beyond Energetic and Scalar measures: Next Generation QTAIM

Abstract:
Next Generation Quantum Theory of Atoms in Molecules (NG-QTAIM) is currently the only vector-based quantum chemical theory as all other quantum chemical theories are scalar-based. NG-QTAIM can, for instance, be used to distinguish enantiomers, isotopomers undergoing normal modes of vibration, predict ring-opening reaction products, ground and excited states at a conical intersection and predict reaction pathways of permutation-inversion isomers. As a consequence, NG-QTAIM can uniquely be used to investigate iso-energetic phenomena where the reliance on differences in geometric measures is removed.

Short CV:
Professor Dr. Samantha Jenkins, professor of Chemistry at Hunan Normal University, Changsha, China, she joined the Hunan 100 Talents Project in 2010. Research interests: Developing the theory of atoms in molecules (QTAIM) to form Next generation QTAIM. She has a track record of research funding in Sweden and China with the National Natural Science Foundation of China (NSFC), has published in high impact journals including the Journal of the American Chemical Society (JACS), an invited perspective article on her research in WiRES: Computational Molecular Science and has a book for Springer/Nature on her researchdue to be published on the subject in April 2023. In 2013 she won a Chinese Government Friendship Award and in 2021 received the Hunan International Science and Technology Cooperation First Class Award.


Supported by JSPS KAKENHI Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A) “Material Science of Meso Hierarchy”