生命科学研究部門

生命機能情報分野

名前 所属 職名
重田 育照 教授/部門主任
原田 隆平 准教授
庄司 光男 助教
西澤 宏晃 助教
堀 優太 助教
鬼頭(西岡) 宏任 研究員
森田 陸離 研究員
満田 祐樹 研究員
Kowit Hengphasatporn 研究員
広川 貴次 医学医療系 教授(共同研究員)
吉野 龍ノ介 医学医療系 助教(共同研究員)

分子進化分野

名前 所属 職名
稲垣 祐司 教授/分野リーダー
石谷 佳之 研究員
橋本 哲男 生命環境系 生物科学専攻長(後期)/教授(共同研究員)

生命機能情報分野

氏名 重田 育照
Name Shigeta Yasuteru
所属
所属研究科/学類 数理物質科学研究科/理工学群 物理学類
職名 教授/部門主任
研究テーマ ナノ-バイオ系の計算シミュレーション
関連リンク
Email shigetaccs.tsukuba.ac.jp
harada 氏名 原田 隆平
Name Harada Ryuhei
所属
所属研究科/学類 生命環境科学研究科/生命環境学群 生物学類
職名 准教授
研究テーマ タンパク質の分子動力学シミュレーション
関連リンク
Email ryuheiccs.tsukuba.ac.jp
氏名 庄司 光男
Name Shoji Mitsuo
所属
所属研究科/学類 数理物質科学研究科/理工学群 物理学類
職名 助教
研究テーマ 生体酵素反応の理論解析
関連リンク
Email mshojiccs.tsukuba.ac.jp
氏名 西澤 宏晃
Name Nishizawa Hiroaki
所属
所属研究科/学類 数理物質科学研究科/理工学群 物理学類
職名 助教
研究テーマ 中分子創薬に対する量子・古典混合分子動力学シミュレーション
関連リンク
Email nisizawaccs.tsukuba.ac.jp
氏名 堀 優太
Name Hori Yuta
所属
所属研究科/学類 数理物質科学研究科/理工学群 物理学類
職名 助教
研究テーマ プロトン・電子・ヒドリド移動に関する理論的研究、酵素触媒反応の理論解析、星間有機分子の理論的研究
関連リンク
Email horiccs.tsukuba.ac.jp
氏名 鬼頭(西岡) 宏任
Name Kitoh-Nishioka Hirotaka
所属
所属研究科/学類
職名 研究員
研究テーマ 生体系と有機半導体における励起移動と電荷移動の理論とシミュレーション、フラグメント分子軌道法のGPU加速コンピューティング
関連リンク
Email hkitoccs.tsukuba.ac.jp
氏名 森田 陸離
Name Morita Rikuri
所属
所属研究科/学類
職名 研究員
研究テーマ 分子動力学を用いた中分子化合物の結合解離過程の研究
関連リンク
Email moritaccs.tsukuba.ac.jp
氏名 満田 祐樹
Name Mitsuta Yuki
所属
所属研究科/学類
職名 研究員
研究テーマ 分子シミュレーションを用いた自由エネルギー反応経路探索法の開発
関連リンク
Email mitsutayccs.tsukuba.ac.jp
氏名
Name Kowit Hengphasatporn
所属
所属研究科/学類
職名 研究員
研究テーマ
関連リンク
Email kowithccs.tsukuba.ac.jp
氏名 広川 貴次
Name Hirokawa Takatsugu
所属 医学医療系
所属研究科/学類
職名 教授(共同研究員)
研究テーマ
関連リンク
Email
氏名 吉野 龍ノ介
Name Yoshino Ryunosuke
所属 医学医療系
所属研究科/学類
職名 助教(共同研究員)
研究テーマ 分子シミュレーションを用いた薬理活性化合物の探索、及び構造最適化
関連リンク
Email

分子進化分野

氏名 稲垣 祐司
Name Inagaki Yuji
所属
所属研究科/学類 生命環境科学研究科/生命環境学群 生物学類
職名 教授/分野リーダー
研究テーマ 真核生物の分子系統解析・生物種間での遺伝子水平移動・立体構造と分子進化情報を組み合わせたタンパク質の機能解析・分子系統解析における各種アーティファクトの解析
関連リンク
Email yujiccs.tsukuba.ac.jp
氏名 石谷 佳之
Name Ishitani Yoshiyuki
所属
所属研究科/学類
職名 研究員
研究テーマ 大規模分子データに基づく主要真核生物系統の分岐年代推定
関連リンク
Email ishitaniccs.tsukuba.ac.jp
  • 研究キーワード
  • 経歴
    2017年4月
    -
    現在
    筑波大学 計算科学研究センター 特任研究員
    2015年5月
    -
    2017年3月
    東京大学 大気海洋研究所 特任研究員
    2013年9月
    -
    2015年4月
    グラスゴー大学 地球科学科 日本学術振興会海外特別研究員
    2013年4月
    -
    2013年8月
    独立行政法人海洋研究開発機構 海洋・極限環境生物圏領域 研究支援パート(兼務)
    2013年4月
    -
    2013年8月
    東京大学 理学系研究科 特任研究員(兼務)
    2010年4月
    -
    2013年3月
    独立行政法人海洋研究開発機構 海洋・極限環境生物圏領域 日本学術振興会ポスドク研究員
  • 論文
    Ciacci, C, Grimmelpont, M. V, Corsi, I, Bergami, E, Curzi, D, Burini, D, Bouchet, V. M. P, Ambrogini, P, Gobbi, P, Ujiié, Y, Ishitani, Y, Coccioni, R, Bernhard, J. M, Frontalini, F
    Scientific Reports 19 (9) 2019年12月[査読有り]
    Yurika Ujiie, Yoshiyuki Ishitani
    PLOS ONE 11 (2) 2016年2月[査読有り]
    Yoshiyuki Ishitani, Kiyotaka Takishita
    JOURNAL OF PLANKTON RESEARCH 37 (5) 2015年9月[査読有り]
    有孔虫と放散虫を姉妹群とする「レタリア仮説」
    石谷 佳之, 瀧下 清貴
    化石 (97) 2015年3月[査読有り]
    Yoshiyui Ishitani, Yurika Ujiie, Kiyotaka Takishita
    MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION 78 2014年9月[査読有り]
    Yoshiyuki Ishitani, Ryoma Kamikawa, Akinori Yabuki, Masashi Tsuchiya, Yuji Inagaki, Kiyotaka Takishita
    JOURNAL OF EUKARYOTIC MICROBIOLOGY 59 (4) 2012年7月[査読有り]
    Yurika Ujiie, Takahiro Asami, Thibault de Garidel-Thoron, Hui Liu, Yoshiyuki Ishitani, Colomban de Vargas
    ECOLOGY AND EVOLUTION 2 (7) 2012年7月[査読有り]
    Yoshiyuki Ishitani, Yurika Ujiie, Colomban de Vargas, Fabrice Not, Kozo Takahashi
    PLOS ONE 7 (5) 2012年5月[査読有り]
    Yoshiyuki Ishitani, Yurika Ujiie, Colomban de Vargas, Fabrice Not, Kozo Takahashi
    DEEP-SEA RESEARCH PART II-TOPICAL STUDIES IN OCEANOGRAPHY 61-64 2012年2月[査読有り]
    Ishitani Y, Ishikawa S, Inagaki Y, Tsuchiya M, Takahashi K, Takishita K
    Marine Micropaleontology 81 (1-2) 2011年11月[査読有り]
    北西太平洋西部亜寒帯循環内Station K2におけるレディオラリア(放散虫類)・フラックスの季節変動
    池上 隆仁, 高橋 孝三, 石谷 佳之, 田中 聖二
    海の研究 19 (4) 2010年7月[査読有り]
    Vertical and geographic distribution of selected radiolarian species in the North Pacific
    Yoshiyuki Ishitani, Kozo Takahashi, Yusuke Okazaki, Seiji Tanaka
    MICROPALEONTOLOGY 54 (1) 2008年[査読有り]
    Yoshiyuki Ishitani, Kozo Takahashi
    MARINE MICROPALEONTOLOGY 65 (3-4) 2007年12月[査読有り]
  • 受賞
    2011年10月
    放散虫研究集会 学術賞 第11回放散虫研究集会
    2010年7月
    ISEP young scientist award ISEP XVIII
  • 書籍等出版物
    アメーバのはなし
    石谷 佳之, 土屋正史 (担当:分担執筆, 範囲:海の中にいるヒトに感染しない原生生物)
    Radiolaria
    Yoshiyuki Ishitani, Colette Febvre-Chevalier, Jean Febvre (担当:共著)
    Distribution and geochemical properties of hydrothermal plumes in the Rodriguez Triple Junction
    Noguchi T, Fukuba T, Okamura K, Ijiri A, Yanagawa K, Ishitani Y, Fujii R, Sunamura M (担当:共著)
  • 競争的資金等の研究課題
    海洋原生生物に共生する細菌多様性の実態解明
    国際共同研究強化B【研究分担者】
    研究期間: 2018年10月 - 2023年3月代表者: 稲垣 祐司
    ミトコンドリアDNAポリメラーゼの多様性と進化の全容解明
    基盤研究(B)【研究分担者】
    研究期間: 2019年4月 - 2022年3月代表者: 稲垣 祐司
    大規模分岐年代推定ー真核生物の誕生と進化を解き明かす!!ー
    基盤研究(C)【研究代表者】
    研究期間: 2018年4月 - 2021年3月代表者: 石谷 佳之
    有孔虫における殻形成機構の解明ー石灰化のブラックボックスを開くー
    基盤研究(B)【研究分担者】
    研究期間: 2017年4月 - 2020年3月代表者: 氏家 由利香
    原核藻類と原生生物の光共生に関する研究
    基盤研究(C)【研究分担者】
    研究期間: 2016年4月 - 2019年3月代表者: 藤木 撤一
    浮遊性有孔虫の新規環境指標の確立:遺伝子・安定同位体・形態の複合解析から
    基盤研究(C)【研究協力者】
    研究期間: 2014年4月 - 2017年3月代表者: 氏家 由利香
    放散虫のバイオミネラリゼーションと殻形態進化:化石の分子生物学への応用に向けて
    海外特別研究員
    研究期間: 2013年9月 - 2015年4月代表者: 石谷 佳之
    浮遊性有孔虫の生物多様性と炭素循環の関係の解明
    若手研究(B)【研究協力者】
    研究期間: 2011年4月 - 2014年3月代表者: 氏家 由利香
    環境変遷に基づく放散虫の進化と多様性,古海洋環境指標としての新展望
    特別研究員
    研究期間: 2010年4月 - 2013年3月代表者: 石谷 佳之
    生物学に基づく古海洋学の新展開~放散虫・環境指標としての有用性・可能性の追求~
    日仏二国間交流事業【企画/立案/協力】
    研究期間: 2009年11月代表者: 高橋 孝三
氏名 橋本 哲男
Name Hashimoto Tetsuo
所属 生命環境系
所属研究科/学類
職名 生物科学専攻長(後期)/教授(共同研究員)
研究テーマ 真核生物の起源と初期進化に関する分子進化学的解析
関連リンク
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