2023年5月に公開されたIO500リストで、 Pegasus で実行した CHFS が10ノードチャレンジで21位となりました。
https://io500.org/list/isc23/ten
また、全体リストにおいても 28位となり、これまで国内首位であったJCAHPC の Oakforest-PACS の IME の性能を超えて、国内のファイルシステムとしては最高位となりました。
投稿者: 筑波大学計算科学研究センター
筑波大学のPegasusがIO500で国内ファイルシステムの最高位に
庄司光男助教が量子生命科学会令和5年度学会賞を受賞
計算科学研究センター生命科学研究部門の庄司 光男助教が、量子生命科学会令和5年度学会賞(研究奨励賞)を受賞し、5月19日に授賞式が行われました。
受賞タイトル及び受賞理由は以下の通りです。
受賞タイトル「量子化学計算を活用した複雑酵素反応および生体分子ホモキラリティ機構の解明」
酵素に代表される生体構成分子の電子状態および分子物性における顕著な量子力学的選択性や反応性の理論的解明を目指して、主に量子古典混合計算法などに基づき、光合成光化学系、金属含有タンパク質、ホモキラル・アミノ酸前駆体等の特異な量子物性を明らかにした。
関連リンク:量子生命科学会 https://quliss.org/information
佐藤助教らがHPCIソフトウェア賞開発部門賞の奨励賞を受賞
計算科学研究センターに在籍していた研究者らが中心となって開発したソフトウェア「SALMON(Scalable Ab-initio Light-Matter simulator for Optics and Nanoscience; https://salmon-tddft.jp/)」が、HPCIソフトウェア賞開発部門賞において奨励賞を受賞し、令和5年5月19日(金)に授賞式(オンライン)が行われました。
この賞は、一般社団法人HPCIコンソーシアム(https://www.hpci-office.jp/)が、大規模計算などの計算科学分野の発展に貢献したソフトウェアのうち特に有益と認められたソフトウェアの開発者・団体、あるいは普及に貢献した者・団体を奨励することを目的に設立したものです。
本賞は開発者の中でも40歳以下の若手が対象となるもので、センターからは佐藤 駿丞助教が受賞しました。
ISC2023 Exhibition booth #C308!
ISC2023 will be held on May 21-25, 2023 in Hamburg, Germany and Online.
Please stop by our booth #C308, “CCS/JCAHPC, University of Tsukuba”.
See below for detailed information.
ISC2023: https://www.isc-hpc.com/
Prof. Umemura and Prof. Tanaka have been named Professor Emeritus of the Univ. Tsukuba
Prof. Masayuki Umemura (formerly of the Department of Astrophysics) and Prof. Hiroshi L. Tanaka (formerly of the Department of Environmental Science), who retired in March 2023, have been named Professor Emeritus of the University of Tsukuba.
Professor Emeritus Umemura (left) and Professor Emeritus Tanaka (right).
梅村教授、田中教授が筑波大学名誉教授に選出
計算情報学研究部門(計算メディア分野)助教(テニュアトラック)公募 (締切5月31日)
1.募集人員
助教(テニュアトラック)1名
2.所属組織
筑波大学計算科学研究センター
3.専門分野
医療映像処理、複合現実感・拡張現実および計算メディア技術
4. 職務内容
筑波大学計算科学研究センター*1では、物理学・化学・生物学などの基礎科学、および、計算シミュレーション技術を用いて医学分野と連携し、計算科学による医療技術を開拓する「計算メディカルサイエンス事業」に取り組んでいます。この事業の中のプロジェクトの一つである“3D Surgical Vision”では、3次元映像に基づいた状況認識と拡張現実提示を統合することにより、施術手順や医療技術の直感的な把握を可能とする3次元手術ナビゲーションを実現し、施術レベル・教育効果の向上を目指すと共に、遠隔診断・治療システムの実現を目的とした研究に取り組んでいます。
本公募では、上記計算メディカルサイエンスの研究を行っていただける方を求めます。特に、着任後は意欲的に医学分野と連携して研究活動を推進していただける方を希望します。
また、応募者の適性を判断して、大学院システム情報工学研究群(知能機能システム学位プログラム*2、エンパワーメント情報学プログラム*3)における研究・教育、ならびに、理工学群工学システム学類*4(学部に相当)における教育も担当していただきます。
*1 計算科学研究センター http://www.ccs.tsukuba.ac.jp
*2 システム情報工学研究群知能機能システム学位プログラム http://www.imis.tsukuba.ac.jp
*3 システム情報工学研究群エンパワーメント情報学プログラム http://www.emp.tsukuba.ac.jp
*4 理工学群工学システム学類 https://www.esys.tsukuba.ac.jp
5. 着任時期
2023年度9月1日以降のできるだけ早い時期。
6. 任期
任期5年間のテニュアトラック(基本年俸表適用職員)着任時から原則5年目に学内規定に基づくテニュア審査が行われ、テニュアが取得できた場合は任期なしとなります。
7. 勤務地住所
〒305-8577 茨城県つくば市天王台1-1-1
8. 応募資格
博士の学位を有し(着任時期までに取得見込みも可)、専門分野において優れた研究業績をお持ちで、上記職務に熱意を持って取り組んでいただける方。
9. 待遇
給与:本学規定による。
勤務時間:専門業務型裁量労働制適用(みなし労働:1日7時間45分、週5日勤務、週38時間45分)
雇用形態:常勤
任期:着任日から最長で5年間(テニュアトラック制)
時間外労働:有り(入試、全学的行事、その他臨時業務)
休日:日曜日,土曜日,祝日,12月29日〜1月3日
各種保険:文科省共済組合、厚生年金、雇用保険、及び労災保険等に加入。
【参考】
国立大学法人筑波大学本部等職員就業規則
https://www.tsukuba.ac.jp/images/pdf/2005hks07.pdf
国立大学法人筑波大学本部等職員の給与に関する規則
https://www.tsukuba.ac.jp/images/pdf/2005hks08.pdf
10. 募集締切
2023年05月31日 必着
11. 提出書類:
- 応募概要:氏名、生年月日、現在の所属と職、査読付き学術誌掲載論文数、査読付き国際会議論文数、専門分野を表すキーワード5個を、1ページ以内に記載すること。
- 履歴書:連絡先、電子メールアドレス、高等学校卒業後の学歴・職歴・研究歴、所属学会等を記載すること。写真を付けること。
- これまでの研究の概要:1,500字程度.⑤の主要論文を適宜参照すること。
- 研究業績一覧.査読付き学術誌掲載論文、査読付き国際会議論文、著書、査読無論文、解説、特許、受賞、競争的外部資金獲得実績(期間、金額、研究代表者・分担者の区別を明記)、報道、その他などに分類したリスト。共著者名は全員記入すること。⑤に記載した論文に〇印を付けること。
- 主要論文リスト 5編:最近5年以内のもの。ただし、1編はそれ以前のものでも可。査読付き学術誌掲載論文について、分かる場合はIF=Impact Factor、SNIP=Source Normalized Impact per Paper、被引用文献数(参照したデータベースも明記)を記載のこと。また、査読付き国際会議論文について、わかる場合は会議の h5-index,CORE rank,採択率,被引用文献数(参照したデータベースも明記)を記載すること。
- 5に記載した主要論文のコピー。
- 教育業績 :過去の担当科目・TA経験、指導学生の受賞、学生の指導実績など。
- 着任後の研究・教育に対する計画・抱負と自己アピール:1,500字程度。
- 本人についての意見を求め得る方2名の氏名、所属および連絡先。
- 特定類型自己申告書:本学所定の様式を以下サイト*から入手し、必要事項を記入し、署名すること。
- GDPR適用国(EU加盟国,アイスランド共和国,リヒテンシュタイン公国,ノルウェー王国,英国)からの応募者は、本学所定のGDPR同意書を以下サイト*から入手し、必要事項を記入し、署名すること。該当しない方は提出不要です。
※提出書類の様式および記入例は下記URLからダウンロードできます。
https://www.ccs.tsukuba.ac.jp/reqdocuments/
12. 問い合わせ先
筑波大学 計算科学研究センター計算情報学研究部門 教授 亀田能成
Tel: 029-853-5256 / E-mail: kameda _AT_ ccs.tsukuba.ac.jp
(_AT_ を @ に置き換えてください。)
13. 応募書類送付先
以上の①から⑪を一つのPDFファイルにまとめ、「JREC-IN Portal Web応募」で提出してください。なお、⑩と⑪は必要事項を記入し、署名した書類をスキャンしたものを提出してください(⑩と⑪は後日原本をお送りいただきます)。
JREC-IN 公募情報掲載ページ:https://jrecin.jst.go.jp/seek/SeekJorDetail?fn=3&id=D123041472&ln_jor=0
14. その他
(1) 応募書類に含まれる個人情報は、本人事選考のみに使用し、他の目的には一切使用しません。選考終了後はすべての個人情報を適切に破棄します。
(2) 計算科学研究センターは、文部科学省共同利用・共同研究拠点に認定されており、計算機共同利用を含む学際計算科学を推進しています。筑波大学では男女雇用機会均等法を遵守した人事選考を行っています。
(3) 本学は、「男女共同参画社会基本法」の精神及び「筑波大学ダイバーシティ基本理念・基本計画」の理念・方針に則った人事選考を行っております。
(4) 本学では、「外国為替及び外国貿易法」に基づき、「国立大学法人筑波大学安全保障輸出管理規則」を定め、外国人、外国の大学・企業・政府機関等出身者又は特定類型該当者の雇用に際し厳格な審査を実施しています。
2023年度 一般公開:スーパーコンピュータ「Cygnus」を見に行こう!
2023年度計算科学研究センター一般公開を、2023年4月22日(土)に開催いたします。
2019年4月に運用を開始したスーパーコンピュータ「Cygnus」 を見学できます。また、スーパーコンピュータを使った宇宙の研究についての講演を行います。
予約等は不要です。直接会場までお越しください。
【講演】「スーパーコンピュータを使った宇宙の研究」
計算科学研究センター ワークショップ室 (14:00-14:30)
話し手:福島肇 先生
【施設見学】
計算科学研究センター 計算機室 (13:00-16:00):
スーパーコンピュータ「Cygnus」を間近でご覧いただけます!
計算科学研究センター 1F 展示フロア (13:00-16:00):
歴代のスーパーコンピュータやスーパーコンピュータ「Oakforest-PACS」のノードを展示しています。
日 程:2023年4月22日(土)
場 所:筑波大学計算科学研究センター 交通アクセス
参加費:無料。団体見学可(事前にご連絡ください)。
お問合せ:pr [at] ccs.tsukuba.ac.jp (@を[at]と表示しています)
関連リンク:
・筑波大学科学技術週間キッズユニバーシティ
4月22日、筑波大学では計算科学研究センター以外でも、特別授業や科学実験をはじめ、さまざまなイベントを開催します。「一日筑波大生」になって、科学の面白さと大学の魅力を体感しよう!
2023年4月
一般公開実施担当者一同
Job opening of Assistant Professor (fixed term) position in CCS, University of Tsukuba
Position Title: Assistant professor (fixed term)
Affiliation: Division of Life Science, Center for Computational Sciences, University of Tsukuba
Field of Expertise: Computational chemistry including materials informatics, quantum chemistry, and molecular simulations.
Research: In our center, we seek a fixed-term assistant professor to develop computational methods using materials informatics (MI), classical molecular dynamics (MD) simulations, quantum chemical (QC) calculations, and/or apply it to actual problems in the field of the grant-in-aid for Transformative Research Areas “Mesohierarchy”. The successful candidate will be a member of the Divisions of Life Science. He/She will collaborate with experimental researchers in the field of Mesohierarchy. Based on the candidates’ expertise, he/she can teach in the faculty of physics, chemistry, or biology.
Starting date: October 1st, 2023 or later, as soon as possible
Period: Until September 30th, 2026 (After evaluation, he/she can extend it until March 31st, 2027)
Requirement: Applicants must have a doctoral degree or equivalent expertise.
Compensation
・Salary: Annual salary system (The annual salary will be determined based on the regulations of the University, taking into account the career of the employee.)
・Working hours: Discretionary labor system
・Holidays: Saturdays, Sundays, national holidays, New Year’s holidays (Dec.29 Jan. 3), and holidays determined by the University.
Submissions
1) Resume/CV (with photograph)
2) List of research activities including peer-reviewed papers, peer-reviewed proceedings, oral presentations at international conferences, competitive research funds (representative), awards, and so on.
3) Up to five major papers (at least four of which were published within the last five years)
4) Summary of research to date (within 1 sheet of A4 paper)
5) Research and education proposal (within 1 sheet of A4 paper)
6) A list of grants
7) A recommendation letter or the name of one professor, who is a reference for the applicant, with complete contact information
8) A document for Self-declaration on Specific Categories (*)
9) A document for Consent to Processing and Extraterritorial Transfer of Personal Data under GDPR (*) (EU General Data Protection Regulation) (Only the applicants located in the countries where belong to the European Economic Area or in the United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland should submit the consent form).
*All of the standardized forms can be downloaded from the following link: https://www.ccs.tsukuba.ac.jp/reqdocuments/
Submission deadline: Wednesday, May 31th, 2023 (JST).
Please write “Application for Assistant Professor Position in Computational Medical Science (Mesohierarchy)” on the subject and send a zip file with a password for the documents (1-6) in the pdf format via e-mail to apply_2023_L02 [at]ccs.tsukuba.ac.jp ([at] should be replaced by @). The password should be separately sent to shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp ([at] should be replaced by @ as well).
Contact address: Yasuteru Shigeta
(Tel: +81-29-853-6496, Email: shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp)
Miscellaneous: The Center for Computational Sciences has been approved as a Joint Collaborative Research Center by the Ministry of Education, Culture, Sports, Science, and Technology. We promote interdisciplinary computational sciences, including joint use of our supercomputer systems. The University of Tsukuba conducts its personnel selection process in compliance with the Equal Employment Opportunity Act.
生命科学研究部門 助教(任期付)公募(締切5月31日)
公募人員:任期付き助教1名
所属組織:筑波大学計算科学研究センター
専門分野:当センターでは, 学術変革領域研究A「メゾヒエラルキーの物質科学」において, マテリアルズインフォマティクス, 分子シミュレーション, 量子化学計算などを用いたメゾヒエラルキー物質の構造形成・機能発現メカニズムに関する研究を実施する, 任期付き助教を募集します。また,応募者の適性を判断して, 大学院理工情報生命学術院, および理工学群,あるいは, 生命環境学群において,教育・研究指導を担当していただきます。実験研究者との共同研究に意欲的に取り組んで頂ける方を希望します。
着任時期:2023年10月以降できるだけ早い時期
任期:3年 (審査を経て1年6ヶ月延長の可能性があります)
応募資格:博士の学位を有する者, あるいはそれと同等の力量をもつ者
提出書類:
1)履歴書(写真貼付)
2)業績リスト(査読論文とその他を区別すること)
3)主要論文別刷5編(うち4編以上は最近5年以内のもの)と要約(それぞれA4用紙1枚分程度)
4)これまでの研究の概要(A4用紙1枚分程度)
5)着任後の研究計画と教育に関する抱負(それぞれ、A4用紙1枚分程度)
6)外部資金の獲得状況
7)照会可能者1名の氏名・連絡先、もしくは推薦書
8)特定類型自己申告書※
9)EU一般データ保護規則(GDPR)に基づく個人データの取扱い及び域外移転に関する同意書※ (欧州経済領域(European Economic Area)の構成国及び英国在住 者のみ提出をお願いします。)
※提出書類の様式および記入例は下記URLからダウンロードできます。
https://www.ccs.tsukuba.ac.jp/reqdocuments/
応募締切:2023年5月31日(水)必着
応募方法:サブジェエクト名を「助教公募(学術変革領域研究A)」として、上記のファイルを圧縮し、暗号化した上で apply_2023_L02[at]ccs.tsukuba.ac.jp までメール送付してください。パスワードは、shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jpにお送りください。([at]→@)
【問合せ先】重田 育照(Tel: 029-853-6496, Email: shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp)
その他:計算科学研究センターは,文部科学省共同利用・共同研究拠点に認定されており,計算機共同利用を含む学際計算科学を推進しています。本学は、「男女共同参画社会基本法」の精神及び「筑波大学ダイバーシティ基本理念・基本計画」の理念・方針に則った人事選考を行っております。また、本学は、「外国為替及び外国貿易法」に基づき、「国立大学法人筑波大学安全保障輸出管理規則」を定め、外国人、外国の大学・企業・政府機関等出身者又は特定類型該当者の雇用に際し厳格な審査を実施しています。
Job opening of Professor/Associate Professor (fixed term) position in CCS, University of Tsukuba
Position Title: Professor or Associate professor (fixed term)
Affiliation: Division of Life Science, Center for Computational Sciences, University of Tsukuba
Field of Expertise: In the Center for Quantum and Information Lifesciences, experimental or theoretical research on the structural dynamics and functional expression mechanisms of proteins and other biomolecules.
Research: In our center, we seek a fixed-term professor/associate professor to develop experimental or computational methods to reveal the structural dynamics and the functional expression mechanisms of proteins. The successful candidate will be a member of the Divisions of Life Science. He/She will collaborate with other members in the center. Based on the candidates’ expertise, he/she can teach in the faculty of physics, chemistry, or biology.
Starting date: August 16th, 2023 or later, as soon as possible
Period: Until March 31st, 2027
Requirement: Applicants must have a doctoral degree or equivalent expertise.
Compensation
・Salary: Annual salary system (The annual salary will be determined based on the regulations of the University, taking into account the career of the employee.)
・Working hours: Discretionary labor system
・Holidays: Saturdays, Sundays, national holidays, New Year’s holidays (Dec.29 Jan. 3), and holidays determined by the University.
Submissions
1) Resume/CV (with photograph)
2) List of research activities including peer-reviewed papers, peer-reviewed proceedings, oral presentations at international conferences, competitive research funds (representative), awards, and so on.
3) Up to five major papers (at least four of which were published within the last five years)
4) Summary of research to date (within 1 sheet of A4 paper)
5) Research and education proposal (within 1 sheet of A4 paper)
6) A list of grants
7) A recommendation letter or a list of names of two professors, who are references for the applicant, with complete contact information
8) A document for Self-declaration on Specific Categories (*)
9) A document for Consent to Processing and Extraterritorial Transfer of Personal Data under GDPR (*) (EU General Data Protection Regulation) (Only the applicants located in the countries where belong to the European Economic Area or in the United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland should submit the consent form).
*All of the standardized forms can be downloaded from the following link: https://www.ccs.tsukuba.ac.jp/reqdocuments/
Submission deadline: Wednesday, May 24th, 2023 (JST).
Please write “Application for Professor/Associate Professor Position in Quantum and Information Lifesciences ” on the subject and send a zip file with a password for the documents (1-6) in the pdf format via e-mail to apply_2023_L01 [at]ccs.tsukuba.ac.jp ([at] should be replaced by @). The password should be separately sent to shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp ([at] should be replaced by @ as well).
Contact address: Yasuteru Shigeta
(Tel: +81-29-853-6496, Email: shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp)
Miscellaneous: The Center for Computational Sciences has been approved as a Joint Collaborative Research Center by the Ministry of Education, Culture, Sports, Science, and Technology. We promote interdisciplinary computational sciences, including joint use of our supercomputer systems. The University of Tsukuba conducts its personnel selection process in compliance with the Equal Employment Opportunity Act.
生命科学研究部門 教授もしくは准教授(任期付)公募(締切5月24日)
公募人員:任期付き教授、もしくは准教授1名
所属組織:筑波大学計算科学研究センター
専門分野:当センターでは, 拠点形成事業「量子生命情報研究センター」において, タンパク質などの生体内分子の構造ダイナミクス・機能発現メカニズムに関わる, 実験もしくは理論研究を実施する, 任期付き教授, もしくは准教授を募集します。また,応募者の適性を判断して, 大学院理工情報生命学術院,および理工学群,あるいは, 生命環境学群において,教育・研究指導を担当していただきます(複数の教育組織の中から選ぶことができます)。量子生命情報科学センターに所属する研究者との学際的共同研究に意欲的に取り組んで頂ける方を希望します。センターに関する情報については, 下記の問い合わせ先に連絡をしてください。
着任時期:2023年8月以降できるだけ早い時期
任期:2027年3月末まで
応募資格:博士の学位を有する者
提出書類:
1)履歴書(写真貼付)
2)業績リスト(査読論文とその他を区別すること)
3)主要論文別刷5編(うち4編以上は最近5年以内のもの)とその要約(A4用紙1枚程度)
4)これまでの研究の概要(A4用紙1枚分程度)
5)着任後の研究計画と教育に関する抱負(A4用紙1枚分程度)
6)外部資金の獲得状況
7)照会可能者2名の氏名・連絡先、もしくは推薦書
8)特定類型自己申告書※
9)EU一般データ保護規則(GDPR)に基づく個人データの取扱い及び域外移転に関する同意書※ (欧州経済領域(European Economic Area)の構成国及び英国在住者のみ提出をお願いします。)
※提出書類の様式および記入例は下記URLからダウンロードできます。
https://www.ccs.tsukuba.ac.jp/reqdocuments/
応募締切:2023年5月24日(水)必着
応募方法:サブジェエクト名を「教授、もしくは准教授公募(量子生命情報研究センター)」として、上記のファイルを圧縮し、暗号化した上で apply_2023_L01[at]ccs.tsukuba.ac.jp までメール送付してください。パスワードは、shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp にお送りください。([at]→@)
【問合せ先】重田 育照(Tel: 029-853-6496, Email: shigeta[at]ccs.tsukuba.ac.jp [at]→@)
その他:計算科学研究センターは,文部科学省共同利用・共同研究拠点に認定されており,計算機共同利用を含む学際計算科学を推進しています。本学は、「男女共同参画社会基本法」の精神及び「筑波大学ダイバーシティ基本理念・基本計画」の理念・方針に則った人事選考を行っております。また、本学は、「外国為替及び外国貿易法」に基づき、「国立大学法人筑波大学安全保障輸出管理規則」を定め、外国人、外国の大学・企業・政府機関等出身者又は特定類型該当者の雇用に際し厳格な審査を実施しています。
Computational Science Seminar on Next Generation Quantum Chemical Theory
Dr. Samantha Jenkins is invited to present a seminar on the next generation of quantum chemistry theory (NG-QTAIM).
Date: April 26 (wed), 2022 12:00-
Venue: Meeting Room B, Center for Computational Sciences, University of Tsukuba
Language: English
Speaker: Professor Dr. Samantha Jenkins
Presentation title: Beyond Energetic and Scalar measures: Next Generation QTAIM
Abstract:
Next Generation Quantum Theory of Atoms in Molecules (NG-QTAIM) is currently the only vector-based quantum chemical theory as all other quantum chemical theories are scalar-based. NG-QTAIM can, for instance, be used to distinguish enantiomers, isotopomers undergoing normal modes of vibration, predict ring-opening reaction products, ground and excited states at a conical intersection and predict reaction pathways of permutation-inversion isomers. As a consequence, NG-QTAIM can uniquely be used to investigate iso-energetic phenomena where the reliance on differences in geometric measures is removed.
Short CV:
Professor Dr. Samantha Jenkins, professor of Chemistry at Hunan Normal University, Changsha, China, she joined the Hunan 100 Talents Project in 2010. Research interests: Developing the theory of atoms in molecules (QTAIM) to form Next generation QTAIM. She has a track record of research funding in Sweden and China with the National Natural Science Foundation of China (NSFC), has published in high impact journals including the Journal of the American Chemical Society (JACS), an invited perspective article on her research in WiRES: Computational Molecular Science and has a book for Springer/Nature on her researchdue to be published on the subject in April 2023. In 2013 she won a Chinese Government Friendship Award and in 2021 received the Hunan International Science and Technology Cooperation First Class Award.
Supported by JSPS KAKENHI Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A) “Material Science of Meso Hierarchy”
次世代の量子化学理論に関する計算科学セミナー
Samantha Jenkins先生をお招きして、次世代の量子化学理論(NG-QTAIM)についてご紹介いただくセミナーを開催いたします。
日時:2022年4月26日(水) 12:00~
場所:筑波大学 計算科学研究センター 会議室BとZoomによるハイブリッド(Zoomによる発表)
使用言語:英語
発表者:Professor Dr. Samantha Jenkins
発表題名:Beyond Energetic and Scalar measures: Next Generation QTAIM
発表概要:
Next Generation Quantum Theory of Atoms in Molecules (NG-QTAIM) is currently the only vector-based quantum chemical theory as all other quantum chemical theories are scalar-based. NG-QTAIM can, for instance, be used to distinguish enantiomers, isotopomers undergoing normal modes of vibration, predict ring-opening reaction products, ground and excited states at a conical intersection and predict reaction pathways of permutation-inversion isomers. As a consequence, NG-QTAIM can uniquely be used to investigate iso-energetic phenomena where the reliance on differences in geometric measures is removed.
略歴:
Professor Dr. Samantha Jenkins, professor of Chemistry at Hunan Normal University, Changsha, China, she joined the Hunan 100 Talents Project in 2010. Research interests: Developing the theory of atoms in molecules (QTAIM) to form Next generation QTAIM. She has a track record of research funding in Sweden and China with the National Natural Science Foundation of China (NSFC), has published in high impact journals including the Journal of the American Chemical Society (JACS), an invited perspective article on her research in WiRES: Computational Molecular Science and has a book for Springer/Nature on her researchdue to be published on the subject in April 2023. In 2013 she won a Chinese Government Friendship Award and in 2021 received the Hunan International Science and Technology Cooperation First Class Award.
協賛:学術変革領域研究(A)「メゾヒエラルキーの物質科学」
CCS – LBNL Collaborative Workshop 2023
Date: April 12th (Wed) – 13th (Thu), 2023
Venue: International Workshop Room, Center for Computational Sciences, University of Tsukuba
DAY-1
start | end | Speaker (Chair) |
|
10:00 | 10:20 | Taiske Boku (Y. Inagaki) |
Research activity update of CCS |
10:20 | 10:45 | Jonathan Carter (T. Boku) |
Current and Future Directions of Computing Sciences at Berkeley Lab |
10:45 | 11:00 | Coffee break | |
11:00 | 11:25 | Doan Quang Van (J. Carter) |
Identifying the “new normal” in regional climate under global warming: the utilization of a state-of-the-art high-resolution atmospheric model. |
11:25 | 11:50 | Michael Wehner (D. Quang Van) |
End to end to attribution: From hot air to environmental justice |
11:50 | 12:10 | Short discussion over coffee | |
12:10 | 12:20 | Group photo | |
12:20 | 13:30 | Lunch break | |
13:30 | 15:00 | Breakout sessions Room#1 (Workshop Room): Particle Physics, Astrophysics, Nuclear Physics, Quantum Condensed Matter Physics Room#2 (Meeting Room A): Life Science, Global Environmental Science Room#3 (Meeting Room B): HPC, Informatics |
|
15:00 | 15:30 | Summary of breakout sessions | |
15:30 | 15:45 | Coffee break | |
15:45 | 16:10 | Sarah Poon (M. Wehner) |
Designing for Expert Use |
16:10 | 16:35 | Masao Mori (S. Poon) |
Galaxy Collisions and Evolution of Galaxies |
16:35 | 16:50 | Zarija Lukic (M. Mori) |
Simulations and modeling at LBL’s Computational Cosmology Center |
DAY-2
9:00 | 9:25 | Takashi Nakatsukasa (Y. Inagaki) |
Nuclear deformation and stability. |
9:25 | 9:50 | Akira Nukada (T. Nakatsukasa) |
Easy software porting to GPU systems: experience with OpenSWPC |
9:50 | 10:15 | Khaled Ibrahim (A, Nukada) |
Performance Analysis and Tuning for Scientific Deep-Learning Workloads |
10:15 | 10:35 | Short discussion over coffee | |
10:35 | 11:00 | Hiroshi Ohno (K. Ibrahim) |
Lattice QCD studies on strong-interaction matter under extreme conditions of temperature and/or density |
11:00 | 11:25 | Kowit Hengphasatpor (H. Ohno) |
Exploring Antiviral Drug Discovery through Computational Calculations and Fragment Molecular Orbital (FMO) Method |
11:25 | 11:50 | Kazuhiro Yabana (K. Hengphasatpor) |
Development and applications of SALMON – First-principles computations in optical science – |
11:50 | 12:10 | Short discussion over coffee | |
12:10 | 14:00 | Lunch break | |
14:00 | 14:25 | Toshiyuki Amagasa (K. Yabana) |
Entity-based data integration using knowledge bases |
14:25 | 14:50 | John Wu (T. Amagasa) |
Fuzzy Dataset Matching for Data Integration |
14:50 | 14:55 | Jonathan Carter |
CCS – LBNL Collaborative Workshop 2023
Date: April 12th (Wed) – 13th (Thu), 2023
Venue: International Workshop Room, Center for Computational Sciences, University of Tsukuba
DAY-1
start | end | Speaker (Chair) |
|
10:00 | 10:20 | Taiske Boku (Y. Inagaki) |
Research activity update of CCS |
10:20 | 10:45 | Jonathan Carter (T. Boku) |
Current and Future Directions of Computing Sciences at Berkeley Lab |
10:45 | 11:00 | Coffee break | |
11:00 | 11:25 | Doan Quang Van (J. Carter) |
Identifying the “new normal” in regional climate under global warming: the utilization of a state-of-the-art high-resolution atmospheric model. |
11:25 | 11:50 | Michael Wehner (D. Quang Van) |
End to end to attribution: From hot air to environmental justice |
11:50 | 12:10 | Short discussion over coffee | |
12:10 | 12:20 | Group photo | |
12:20 | 13:30 | Lunch break | |
13:30 | 15:00 | Breakout sessions Room#1 (Workshop Room): Particle Physics, Astrophysics, Nuclear Physics, Quantum Condensed Matter Physics Room#2 (Meeting Room A): Life Science, Global Environmental Science Room#3 (Meeting Room B): HPC, Informatics |
|
15:00 | 15:30 | Summary of breakout sessions | |
15:30 | 15:45 | Coffee break | |
15:45 | 16:10 | Sarah Poon (M. Wehner) |
Designing for Expert Use |
16:10 | 16:35 | Masao Mori (S. Poon) |
Galaxy Collisions and Evolution of Galaxies |
16:35 | 16:50 | Zarija Lukic (M. Mori) |
Simulations and modeling at LBL’s Computational Cosmology Center |
DAY-2
9:00 | 9:25 | Takashi Nakatsukasa (Y. Inagaki) |
Nuclear deformation and stability. |
9:25 | 9:50 | Akira Nukada (T. Nakatsukasa) |
Easy software porting to GPU systems: experience with OpenSWPC |
9:50 | 10:15 | Khaled Ibrahim (A, Nukada) |
Performance Analysis and Tuning for Scientific Deep-Learning Workloads |
10:15 | 10:35 | Short discussion over coffee | |
10:35 | 11:00 | Hiroshi Ohno (K. Ibrahim) |
Lattice QCD studies on strong-interaction matter under extreme conditions of temperature and/or density |
11:00 | 11:25 | Kowit Hengphasatpor (H. Ohno) |
Exploring Antiviral Drug Discovery through Computational Calculations and Fragment Molecular Orbital (FMO) Method |
11:25 | 11:50 | Kazuhiro Yabana (K. Hengphasatpor) |
Development and applications of SALMON – First-principles computations in optical science – |
11:50 | 12:10 | Short discussion over coffee | |
12:10 | 14:00 | Lunch break | |
14:00 | 14:25 | Toshiyuki Amagasa (K. Yabana) |
Entity-based data integration using knowledge bases |
14:25 | 14:50 | John Wu (T. Amagasa) |
Fuzzy Dataset Matching for Data Integration |
14:50 | 14:55 | Jonathan Carter |
荷電π電子系が発現するジラジカル性をイオンペア形成によって制御 ~電子スピンを利用した電子・光機能材料の開発に期待~
2023年4月3日
立命館大学
大阪大学
筑波大学
慶應義塾大学
立命館大学生命科学部の前田大光教授と同大学大学院生命科学研究科博士課程後期課程の杉浦慎哉さん(2023年3月修了)らの研究チームは、大阪大学、筑波大学、慶應義塾大学と共同で、近赤外領域に光吸収を示すπ電子系1を新たに合成し、脱プロトン化によって得られるジアニオンがジラジカル2性を示し、共存する対カチオンによってその特性が変調することを解明しました。本研究成果は、2023年3月28日(現地時間)に、米国化学会誌「Journal of the American Chemical Society」に掲載されました。
本件のポイント
■ 脱離可能なプロトン(H+)を有する新たなπ電子系骨格の設計・合成と安定化を実現
■ 脱プロトン化(アニオン化)により溶液状態・結晶状態でイオンペアを形成
■ 2箇所の脱プロトン化によってジラジカル性を観測
■ ジラジカルの安定性や電子スピン分布を共存する対カチオンによって変調
概要
ジラジカルは互いに相互作用する2個の不対電子を有する開殻系3であり、閉殻系4には見られない電子・光物性を示すことから興味が持たれています。ジラジカルは分子構造によって基底状態5が一重項状態6または三重項状態7として存在し、温度に依存して安定な状態が変換されることから磁性材料としての利用が期待できます。研究チームは、きわめて報告例の少ないジアニオンジラジカルπ電子系(QPB2–)の創製に成功しました。QPB2–は近赤外領域である1500 nm付近の光吸収を示し、基底状態では一重項ジラジカルとしてふるまいます。QPB2–のジラジカル特性は共存する対カチオンによって変調され、荷電π電子系のイオンペアリングによってその特性の制御に成功したはじめての例であり、新たな電子・光機能材料への展開の端緒となることが期待されます。本研究は科学研究費補助金および立命館グローバル・イノベーション研究機構(R-GIRO)8などの支援によって実施されました。
掲載論文情報
論文名
Deprotonation-Induced and Ion-Pairing-Modulated Diradical Properties of Partially Conjugated Pyrrole-Quinone Conjunction
著者
Shinya Sugiura, Takashi Kubo, Yohei Haketa, Yuta Hori, Yasuteru Shigeta, Hayato Sakai, Taku Hasobe, and Hiromitsu Maeda
発表雑誌
Journal of the American Chemical Society
掲載日
2023年3月28日(現地時間)
URL
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.3c01025
(DOI: 10.1021/jacs.3c01025)
Prof. UMEMURA Masayuki was awarded the title of Fellow of the Center for Computational Sciences
On March 28, Professor UMEMURA Masayuki (Division of Astrophysics), who retired at the end of FY2022, was awarded the title of Fellow of the Center for Computational Sciences.
Professor Umemura has made significant contributions to education and research in theoretical astrophysics, particularly in the study of the formation of first-generation cosmic objects and galaxy formation by cosmic radiation hydrodynamics. He has also contributed to a wide range of academic fields, including the establishment and promotion of joint research centers such as the Organization for Collaborative Research on Computational Astrobiology, which explores key processes related to the origin of life in the universe through international and interdisciplinary collaborative research, and the Department of Computational Medical Science, which is a medical science-computational science collaboration.
He also served as the director of the Center for Computational Sciences for six years from FY2013 to FY2018 and made significant contributions to the promotion of education and research in computational science and to the management and operation of the Center. For these achievements, the Center for Computational Sciences awarded him the title of Fellow.


梅村雅之先生に計算科学研究センターフェローの称号を授与しました。
去る3月28日、本年度末で定年退職される梅村雅之教授(宇宙物理研究部門)へ計算科学研究センターフェローの称号が授与されました。
梅村教授は理論宇宙物理学、特に宇宙輻射流体力学による宇宙第一世代天体形成、銀河形成の研究に関する教育・研究に多大な貢献をされました。また、宇宙における生命の起源に関わるキープロセスを国際的かつ学際的な共同研究によって探究する宇宙生命連携拠点や、医理工連携による計算メディカルサイエンス事業部といった共同研究拠点の立ち上げ及び研究の推進に尽力されるなど、幅広い学術分野への貢献がありました。
また、計算科学研究センターにおいては、2013年度から2018年度までの6年間に渡りセンター長を務め、計算科学に関する教育研究の推進やセンターの管理運営において多大な貢献をされました。これらの功績により、計算科学研究センターからフェローの称号を授与されました。
■筑波大学計算科学研究センター フェローの一覧
http://www.ccs.tsukuba.ac.jp/ccs_introduction/teacher/fellow


Research Fellows Meeting was held to send off professors who are retiring
On March 28, at the last meeting of the 2022 academic year, a farewell ceremony was held for three teachers who will retire at the end of this academic year.



